Status pencemaran beberapa reference site Sungai Ciliwung hulu didasarkan pada nilai indeks kimia

Sungai Ciliwung sebagai penunjang aktivitas masyarakat di sekitarnya memiliki fungsi dan peranan yang sangat penting sedangkan kondisi kualitas air sungai yang ada sekarang ini cenderung turun dan semakin buruk sehingga tidak sesuai lagi dengan peruntukkannya. Penelitian mengenai sungai Ciliwung bagian hulu saat ini belum banyak dilakukan, seperti yang telah dilakukan pada DAS bagian tengah maupun hilir, sehingga tidak ada data mengenai kondisi perairan S. Ciliwung di daerah hulu sebagal pembanding baik dari segi kualitas maupun kuantitasnya sebagai daerah acuan (reference site). Reference site reference atau yang disebut juga sebagai kondisi oleh Reynoldson et al, (1997) didefinisikan sebagai kondisi yang mewakili grup dengan gangguan pada site sangat minim melalui seleksi karakteristik fisik, kimia, maupun biologi. Oleh karena pada bagian hulu sungai biasanya aktivitas manusia relatif kecil jika dibandingkan dengan bagian hilir, maka pemilihan reference site lebih banyak terdapat dan dijumpai pada bagian hulu sungai. Adapun kondisi reference tersebut digunakan untuk membandingkan atribut biologi dari individu test site reference site dengan grup yang diharapkan mempunyai banyak kesamaan kondisi geografisnya.