Evaluasi lokus kloroplas untuk DNA barcoding pada marga Stelechocarpus (annonaceae) secara in-silico

Turhadi, Turhadi and Hakim, Luchman (2023) Evaluasi lokus kloroplas untuk DNA barcoding pada marga Stelechocarpus (annonaceae) secara in-silico. Agro Bali : Agricultural Journal, 6 (1): 7. pp. 56-64. ISSN 2655-853X

[thumbnail of 2655-853X_6_1_2023-7.pdf]
Preview
Text
2655-853X_6_1_2023-7.pdf - Published Version
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.

Download (539kB) | Preview
Official URL: http://www.unipas.ac.id/

Abstract

Stelechocarpus merupakan salah satu genus anggota famili Annonaceae yang tumbuh di kawasan AsiaPasifik. Sebagai salah satu tumbuhan yang kurang dikenal oleh masyarakat maka perlu adanya upaya konservasi karena jenis Stelechocarpus mempunyai banyak manfaat di bidang farmasi dan kosmetika. Salah satu strategi mendukung upaya konservasi yaitu dengan DNA barcoding yang masih sedikit informasinya untuk jenis Stelechocarpus. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi lokus daerah kloroplas secara in-silico yang dapat digunakan sebagai DNA barcode anggota genus Stelechocarpus (Annonaceae). Penelitian ini dilakukan secara insilico dengan mengekstrak sekuen penanda kloroplas meliputi rbcL, trnL-F, matK, psbA-trnH, dan ndhF yang terdapat pada pangkalan data NCBI. Hasil penelitian yang dilakukan menunjukkan bahwa hanya diperoleh 18 nomor sekuen lokus kloroplas dari dua jenis pada genus Stelechocarpus, meliputi S. burahol dan S. cauliflorus. Lokus psbA-trnH dan ndhF mengindikasikan dapat digunakan sebagai penanda untuk studi keragaman genetik pada S. burahol. Di sisi lain, lokus rbcL, trnL-F, dan matK mengindikasikan dapat digunakan untuk studi keragaman genetik pada genus Stelechocarpus.

Item Type: Article
Uncontrolled Keywords: Conservation, Stelechocarpus burahol, Stelechocarpus. cauliflorus, Annonacea, Genetic resource conservation
Subjects: Medicine & Biology
Medicine & Biology > Cytology, Genetics, & Molecular Biology
Depositing User: - Anneke
Date Deposited: 18 Mar 2024 02:34
Last Modified: 18 Mar 2024 02:35
URI: https://karya.brin.go.id/id/eprint/22894

Actions (login required)

View Item
View Item